石室禅院为区级文物保护单位，位于海沧区新阳街道霞阳村玳瑁山山麓，内祀释迦牟尼。据《海澄县志》记载，为后唐同光三年（公元925年）所建，又据现有古石碑文记载，谓开山时间为唐垂拱二年（公元686年），是闽南千年古刹之一。宋、元、明、清、民国年间曾有过五次重修，明朝时规模最大，“殿宇三重，僧舍六十四间”。现仅存大殿一幢，建于道光年间，经光绪年间重修，遗留至今。现存建筑物占地总面积约5000平方米，寺墙内庭院长21.8米，宽11.5米，进深12米。石室禅院坐南朝北，寺后山上的“游城古寨”、“尖山古寨”为明代戚继光抗倭遗迹。2001年，海沧投资区批拨土地25000平方米用于禅院重新扩大修建。
石室禅院在元、明、清、民国经过多次重建，院内有多块石碑来记载这些历史。明朝末年，倭寇侵扰闽浙沿海，戚继光将军领兵抗倭，倭兵闻风丧胆。玳瑁山至今仍留有戚将军抗倭遗迹——“游城古寨”、“尖山古寨”。禅院前仍留有当年扎兵驻寨时所用马槽，具一定历史参考价值。禅院东侧，为各朝僧尼之墓穴，以清朝居多，院内多存有这些古墓碑，尚未破坏。另有明高僧正旭之母寿域，规模庞大。